Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms