Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms