Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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