Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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HOXD1Q9GZZ0 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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