Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms