Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCDC47Q96A33 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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