Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C6Q969F1 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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