Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KNOP1Q1ED39 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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