Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
HIF1AQ16665 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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