Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms