Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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