Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATP6AP1Q15904 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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