| ZNHIT3 | Q15649 | SNRPGP9-201 | ENST00000456025 | 225 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RPS29P23-201 | ENST00000458635 | 123 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AP005660.1-201 | ENST00000522972 | 293 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC124290.1-202 | ENST00000523342 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC018630.3-201 | ENST00000542637 | 96 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL442163.1-201 | ENST00000557251 | 515 nt | TSL 5 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC136618.2-201 | ENST00000575091 | 400 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC131235.4-201 | ENST00000609288 | 620 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | DSCR8-208 | ENST00000614538 | 403 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC093648.1-201 | ENST00000623546 | 606 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | CBX3P1-201 | ENST00000325243 | 554 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-858P-201 | ENST00000362436 | 107 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | U8.1-201 | ENST00000362843 | 134 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.269-201 | ENST00000364685 | 89 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL390198.1-201 | ENST00000376445 | 320 nt | TSL 2 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | CXADR-203 | ENST00000400165 | 603 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AF130351.1-202 | ENST00000400562 | 808 nt | APPRIS P5 TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MIR1305-201 | ENST00000408300 | 86 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU2-72P-201 | ENST00000411175 | 163 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC021146.8-201 | ENST00000507455 | 733 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC011611.2-201 | ENST00000549888 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MIR1273C-201 | ENST00000578669 | 77 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | PRR13P7-201 | ENST00000605538 | 430 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC012360.2-201 | ENST00000609349 | 391 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC099566.1-205 | ENST00000609411 | 657 nt | TSL 5 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL365204.3-201 | ENST00000612448 | 685 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC018692.1-202 | ENST00000623559 | 676 nt | TSL 5 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC006355.2-201 | ENST00000629240 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | BRDT-206 | ENST00000402388 | 3125 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-655P-201 | ENST00000362858 | 107 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.796-201 | ENST00000364268 | 102 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.799-201 | ENST00000364992 | 102 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | OR51A4-201 | ENST00000380373 | 1002 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.508-201 | ENST00000384502 | 114 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6ATAC2P-201 | ENST00000387943 | 126 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SNORA48.1-201 | ENST00000390879 | 135 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-1025P-201 | ENST00000410629 | 104 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL645937.4-201 | ENST00000419702 | 389 nt | TSL 2 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SLC44A3-AS1-205 | ENST00000424505 | 612 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | BX005214.1-201 | ENST00000427327 | 476 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL024474.2-201 | ENST00000431309 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TRBV26OR9-2-201 | ENST00000432077 | 293 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC012308.1-201 | ENST00000451232 | 178 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | LINC01218-201 | ENST00000515150 | 481 nt | TSL 3 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC011257.1-201 | ENST00000519048 | 281 nt | TSL 3 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC130415.1-201 | ENST00000547569 | 1010 nt | TSL 4 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL157871.3-201 | ENST00000557231 | 293 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC005154.1-222 | ENST00000579024 | 341 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | BNIP3P30-201 | ENST00000601184 | 574 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC068620.3-201 | ENST00000602749 | 560 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL645939.4-201 | ENST00000604495 | 135 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Z82243.1-201 | ENST00000609432 | 473 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL590491.2-201 | ENST00000614608 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC090517.3-201 | ENST00000625170 | 141 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MTND5P10-201 | ENST00000603719 | 1809 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | ZNF209P-201 | ENST00000593450 | 2304 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.33-201 | ENST00000362591 | 102 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SNORA4.3-201 | ENST00000365564 | 137 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-298P-201 | ENST00000390888 | 96 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | CBX3P9-201 | ENST00000402326 | 552 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-174P-201 | ENST00000410406 | 106 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNA5SP100-201 | ENST00000410903 | 110 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNA5SP59-201 | ENST00000410922 | 110 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC114763.2-201 | ENST00000412593 | 826 nt | TSL 2 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC074117.2-201 | ENST00000417130 | 397 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL354941.1-201 | ENST00000438600 | 464 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL356272.1-201 | ENST00000454538 | 832 nt | TSL 2 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SNORD97-201 | ENST00000459187 | 142 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL121594.1-201 | ENST00000475906 | 575 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SUMO2P5-201 | ENST00000506790 | 245 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC097467.1-201 | ENST00000513660 | 370 nt | TSL 5 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | 5S_rRNA.3-201 | ENST00000517021 | 110 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC087518.1-201 | ENST00000524098 | 187 nt | TSL 3 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AP005597.4-201 | ENST00000526762 | 229 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | CR383656.8-201 | ENST00000549046 | 145 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL136038.2-201 | ENST00000553983 | 283 nt | TSL 3 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | LINC00871-202 | ENST00000556071 | 554 nt | TSL 3 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | FAM96A-206 | ENST00000559950 | 561 nt | TSL 2 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC008269.2-201 | ENST00000561915 | 1105 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC099850.3-201 | ENST00000577678 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC004908.3-201 | ENST00000610248 | 625 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | 5S_rRNA.19-201 | ENST00000612131 | 110 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | ZFAT-AS1_2.1-201 | ENST00000613742 | 201 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | GNAS-AS1_4.1-201 | ENST00000616546 | 112 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | 5S_rRNA.18-201 | ENST00000621941 | 110 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | ATP11C-202 | ENST00000361648 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.99-201 | ENST00000363138 | 105 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-1210P-201 | ENST00000363775 | 107 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-622P-201 | ENST00000384272 | 103 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MIR150-201 | ENST00000385048 | 84 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |