Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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