Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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SEC23BQ15437 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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SEC23BQ15437 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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SEC23BQ15437 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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SEC23BQ15437 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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SEC23BQ15437 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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SEC23BQ15437 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23BQ15437 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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SEC23BQ15437 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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SEC23BQ15437 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23BQ15437 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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