Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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