Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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