Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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SPIDRQ14159 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SPIDRQ14159 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SPIDRQ14159 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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