Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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FOXE3Q13461 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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