Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NME3Q13232 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NME3Q13232 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NME3Q13232 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NME3Q13232 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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