Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ERCC8Q13216 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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ERCC8Q13216 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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