Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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FOXC1Q12948 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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FOXC1Q12948 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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FOXC1Q12948 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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FOXC1Q12948 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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FOXC1Q12948 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXC1Q12948 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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