Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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BPTFQ12830 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
BPTFQ12830 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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