Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SH3BP1Q9Y3L3 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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