Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CITED1Q99966 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms