Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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