Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRT31Q15323 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms