Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDCD1Q15116 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms