Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL19A1Q14993 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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COL19A1Q14993 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL19A1Q14993 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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