Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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GPNMBQ14956 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GPNMBQ14956 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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