Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEDD9Q14511 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NEDD9Q14511 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms