Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SCARB2Q14108 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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SCARB2Q14108 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SCARB2Q14108 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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SCARB2Q14108 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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