Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CKAP5Q14008 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms