Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SPTAN1Q13813 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SPTAN1Q13813 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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