Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
APOFQ13790 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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APOFQ13790 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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APOFQ13790 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
APOFQ13790 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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APOFQ13790 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
APOFQ13790 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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