Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RUNX3Q13761 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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