Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PEX6Q13608 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PEX6Q13608 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PEX6Q13608 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms