Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MSLNQ13421 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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