Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATMQ13315 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
ATMQ13315 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATMQ13315 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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