Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAF3Q13114 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms