Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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FOXF1Q12946 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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FOXF1Q12946 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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FOXF1Q12946 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXF1Q12946 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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