Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
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BPTFQ12830 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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BPTFQ12830 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
BPTFQ12830 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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