Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRMP28827 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRMP28827 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRMP28827 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRMP28827 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRMP28827 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPRMP28827 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPRMP28827 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRMP28827 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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