Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPRBP23467 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms