Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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ZBED3Q96IU2 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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ZBED3Q96IU2 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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ZBED3Q96IU2 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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ZBED3Q96IU2 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
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ZBED3Q96IU2 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZBED3Q96IU2 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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