Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FAM3DQ96BQ1 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms