Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZNF248Q8NDW4 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZNF248Q8NDW4 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZNF248Q8NDW4 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZNF248Q8NDW4 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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ZNF248Q8NDW4 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ZNF248Q8NDW4 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF248Q8NDW4 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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