Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LAMA3Q16787 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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LAMA3Q16787 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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LAMA3Q16787 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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LAMA3Q16787 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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LAMA3Q16787 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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LAMA3Q16787 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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LAMA3Q16787 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LAMA3Q16787 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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