Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HIST2H2ACQ16777 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2ACQ16777 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms