Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DDB1Q16531 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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